Когда Эдварду Элрику было одиннадцать лет, а его брату Альфонсу – десять, они совершили огромную ошибку: решили воспользоваться алхимией, чтобы воскресить свою мать. Помня о законе равноценного обмена, они раздобыли достаточно химических элементов, чтобы получить человеческое тело, и начертили круг преобразования. Эд с Алом на своем опыте узнали, почему создание человека строго запрещено: пытаясь воскресить мать, они заигрались в бога и жестоко поплатились за это – Ал потерял свое тело, а Эд – ногу и руку.

Это событие заставило братьев пересмотреть свои приоритеты. Теперь они хотят только одного – вернуть себе прежние тела, и ради этой цели пускаются в долгое путешествие. Эд становится государственным алхимиком – ученым на службе армии родного Аместриса. Ал, чья душа привязана к пустым доспехам, повсюду сопровождает брата, теперь известного как Стальной Алхимик. Впереди у них нелегкие времена: им предстоит принять участие в настоящей войне между людьми и гомункулами – искусственно созданными существами, которые обладают невероятной силой.

Когда Эдвард и Альфонс были совсем маленькими, их отец Хоэнхайм покинул дом. Мать в одиночку растила их, поощряя увлечение детей алхимией – наукой, которой Хоэнхайм посвятил свою жизнь. Алхимия казалась Эду и Алу практически всесильной: пользуясь ею, можно было преобразовывать одни предметы в другие и создавать новые. Были лишь два ограничения. Первое – закон равноценного обмена, гласивший, что для получения чего-либо нужно использовать что-то точно такого же объема. Второе – ни в коем случае нельзя даже пытаться создать человека.

После того, как мать Эда и Ала умерла, они решили преступить главный запрет и воскресить ее. Эта попытка обернулась настоящей трагедией: в результате неудачного преобразования Ал потерял тело, а Эд – ногу и руку, ценой которой он вселил душу брата в огромные доспехи. Теперь перед ними стоит новая задача: любой ценой вернуть себе прежние тела и тем самым исправить свою ошибку. Ради этой цели Эд стал государственным алхимиком, несущим службу в армии Аместриса, родины Элриков. Братья пустились в долгую дорогу, на которой их ждет множество открытий.

По улице ночного Сибудзюку бежал парень. В проулке он наткнулся на напарника, и оба достали оружие, готовые произвести выстрелы. Но это был лишь рефлекс, ибо оба преследовали один и то же объект. Они принимаются обсуждать, где мог скрыться преследуемый человек, и возникает идея, что тот укрылся в канализации. В это время прозвучал выстрел, и Дэнни упал. И хоть подозреваемый был настигнут, произошло нечто странное. Он будто сам себе пустил пулю в голову, но до выстрела просил кого-то не делать этого. Брайн не сумел этого доказать начальнику. А из-за того, что Дэнни погиб, его уволили.

Тем временем в городе проходят митинги на защиту мигрантов. Лишившийся работы Брайан получает письмо, связанное с работой миграционного бюро. Он скомкал письмо и отправил его в урну. Утром он отправился по адресу и прибыл в «Отдел Рубеж». Там его ждал сотрудник. Отдел был открыт по распоряжению правительства и его служащим следовало разбираться с делами, связанными с таинственными существами. Оказалось, что у этих существ имелись те же права, что и у людей, но о них мало кому было известно. Эти существа получили название междуземцев. Имелось немало доказательств тому, что они существовали.

Невиданная по своему размаху катастрофа произошла в тот момент, когда в одной из школ ученик Тайдзю собирался признаться очаровательной Юдзурихе в своих чувствах. Но катастрофа заставила всех людей, проживающих на планете окаменеть. В таком состоянии они провели невероятно длительный период времени. Тайдзю не умер, а лишь считал дни, что проходили один за другим. Ему удалось избавиться от каменных оков. Но он был не единственным, кто вернулся к нормальному состоянию. Сэнку, который также избавился от окаменения, принимается ломать голову над спасением цивилизации.

Тайдзю продолжает думать лишь об Юдзурихе, а Сэнку, как и надлежит юному ученому, методом проб и ошибок пытается спасти как можно больше людей от каменного плена. Тайдзю вынужден ему помогать, чтобы ускорить этот процесс. Сэнку продолжает свои исследования, но помимо этого становится и участником вполне даже занятных приключений. А численность тех, кто избавляется от каменного сна, лишь увеличивается, что привносит в будни свои нюансы. Кроме этого, окружающий мир сильно изменился, и теперь человеку следует позаботиться о своем выживании и безопасности, поскольку вокруг немало диких зверей.

Будучи учащимся начальной школы Рюхэй Ода, как и полагается всем детям, имел некий образец для подражания. Мальчик видел почти идеальным человеком своего старшего брата. Практически все, что делал брат, Рюхэй воспринимал с благоговением. Впрочем, парень, на которого взирали с восторгом детские глаза, и в самом деле, обладал весьма хорошими качествами, такими, как доброта и умение понимать другого человека, он мог прийти на помощь и просто побеседовать по душам так, что его собеседнику становилось значительно лучше. Не восхищаться таким братом Рюхэй просто не имел права и любой бы на его месте так же поступал бы.

Но судьба распорядилась жестоко судьбой парня и старший брат Рюхэя погиб, причем на его глазах. Смерть старшего брата имела едва ли не таинственные черты. Прошло время с того страшного дня, и сам Рюхэй превратился в радостного парня, учащегося в старшем классе. Но кошмар, что он испытал, так и не покинул его сознание. Мальчик проходил тренировку по кикбоксингу, и в этот момент его укусило странное создание Трис. И тогда-то Рюхэй увидел необычный сон, не схожий на обычные, что приходят каждую ночь. С того момента начинается борьба парня с его извращенными желаниями.